早年经历
约翰·斯托克顿是学校的棒球和篮球两栖明星，大学就读于贡萨加大学。
运动生涯
初期
1984年选秀大会上，犹他爵士在以首轮16顺位挑走了约翰·斯托克顿，这一年的选秀会还涌现了哈基姆·奥拉朱旺、迈克尔·乔丹和查尔斯·巴克利。一年之后，球队又通过选秀得到了卡尔·马龙，一起在NBA的日子里，斯托克顿和马龙成为最持久高效的一对“后卫/前锋”拍档。
在斯托克顿的最初两个赛季，他担任的是队中控球后卫里基·格林（RickyGreen）的替补。1984-85赛季，约翰·斯托克顿创下球队的新秀助攻纪录（415次）和抢断纪录（109次）并赢得了最佳新秀阵容选票的时候。斯托克顿在82场比赛中每场出场18.2分钟，得到5.6分，爵士队在中西区排名第四，他们在季后赛击败火箭，而后输给掘金。
1985-86赛季，第二个赛季斯托克顿的出场时间增至23.6分钟，他的成绩是每场7.7分7.4助攻。马龙在爵士的第一个赛季每场得到14.9分8.9个篮板，被选入新秀第一阵容，爵士队比上赛季多胜一场，但季后赛首轮就败给了达拉斯小牛队。
1986-87赛季之前，球队用他们此前7个赛季的头号得分手阿德里安·丹特利和活塞交换了肯特·本森和凯利·特里普卡。这为马龙铺平了首席得分手的路。开始与斯托克顿共同奏响了完美的挡拆进行曲。两人的组合导致了NBA的播音员年鉴上产生了一个被不厌其烦重复的短语：“StocktontoMalone”。赛季开始之后，斯托克顿开始成为首发，但要和格林分享上场时间。斯托克顿每场出场22.7分钟，得到7.9分8.2个助攻。而格林的三项数字是25.8、9.6和6.7。两人一共抢断287次，其中斯托克顿的177次列联盟第八。但是不管是斯托克顿，还是从学生时代就被叫作“
邮差”的马龙，都还难以带来季后赛的胜利。爵士在先胜两场的情况下被金州勇士逆转，第一轮出局，斯托克顿在五场比赛中投篮命中率高达62.1%。他每场贡献10分8次助攻。
巅峰期
1987-88赛季伊始，夏洛特黄蜂通过扩军选秀挑走了瑞奇·格林。斯托克顿终于独自占有犹他主力控球后卫的位子，他的成绩突飞猛进。爵士全队的投篮命中率达到49.1%，全年助攻1128次，打破了此前伊塞亚·托马斯保持的1123次的纪录。斯托克顿平均每场拿下13.8次助攻，这个数字在接下来三年两次被他自己
超越，这也是连续九次助攻王的第一次。虽然他的助攻技术已经足够让他在NBA占据一席之地，但他也正在发展成一个全能球员：每场2.95次抢断列联盟第三，57.4%的恐怖命中率列联盟第四，还有14.7分的平均得分。他的数据比起上一年基本翻了一倍，他和马龙一起入选了最佳阵容二队。爵士以47胜35负的球队历史最好战绩进入季后赛，首轮击败开拓者后，他们与洛杉矶湖人队相遇。卫冕冠军经过七场恶战才得以过关。第五场比赛，尽管爵士以109比111惜败，斯托克顿追平了魔术师（埃尔文·约翰逊）创下的季后赛单场助攻24次的纪录，11场季后赛中，斯托克顿的平均成绩时19.5分14.8次助攻。
1988-89赛季，斯托克顿首次被选入全明星赛，经过一场11分17个助攻的表演后，他在全明星MVP评选中仅次于队友马龙。他的助攻和抢断同列联盟第一（每场13.6次助攻，3.21次抢断）。投篮命中率第十（53.8%）。最佳阵容二队和最佳防守阵容二队。每场17.1的得分，在队中排第三位。（马龙29.1，贝利19.5）爵士队战绩51胜31负，已经足够拿到中西区冠军。他们情绪高涨的面对穆林带领的金州勇士队。尽管斯托克顿有平均27.3分13.7次助攻的超级表演，他们仍然被横扫出局。
1989-90赛季，斯托克顿缺席了前四场比赛，不过这不妨碍他再次刷新单赛季个人助攻记录为1134次。平均每场14.5个。在连续第三个赛季助攻超过1000次后，斯托克顿成为第一个拥有两个以上助攻数超过1000的赛季的球员。斯托克顿连续第三年投篮命中率超过50%（51.4%）；第三年至少抢断200次（207）。他的平均得分是生涯最高的17.2分，被选为了全明星西部首发控球后卫，并在赛季结束入选最佳阵容二队。爵士在赛季末失去了状态，延续了他们的“季后赛首轮之旅”，输给了菲尼克斯太阳队。斯托克顿季后赛投篮命中率只有42%，但是仍然每场得15分，助攻15次。
1990-91赛季，马龙每场29分，命中率52.7%，而新加盟的得分手杰夫·马龙平均得到18.6分，命中率50.8%。斯托克顿的任务就是给他们传球，他再次助攻超过1000次，再次被选入全明星赛。斯托克顿以1164次助攻再次刷新了自己保持的单赛季助攻总数纪录，他同样以17.2分的平均得分平了自己的最好成绩。2.85次的平均抢断是联盟第二名，他入选了最佳阵容三队。斯托克顿小心的对付自己的竞争
对手，最佳阵容二队的太阳控球后卫凯文·约翰逊。爵士以3比1在季后赛首轮击败太阳，但他们没有足够的火力继续击败开拓者，斯托克顿在季后赛仍然贡献多多，平均18.2分13.8个助攻。
1991-92赛季，斯托克顿拿到自己连续第五个助攻王（总助攻1126次，平均每场13.7次）。而在赛季的最后一天，他超越了森林狼队的迈克尔·威廉姆斯，以每场抢断2.98次成为抢断王。斯托克顿在第四次出席全明星赛，又一次被选进最佳阵容二队，爵士季后赛之路大有长进，连续击败快船和超音速之后进入了西区决赛。最终，斯托克顿和伙伴们还是战力不足，在西区决赛中输给了波特兰开拓者队，在总共16场季后赛中，斯托克顿平均每场得到14.8分，13.6次助攻和2.13次抢断。
1992-1993赛季，全明星赛在盐湖城召开，爵士也获得了联盟最佳的主场战绩。相应地，斯托克顿和马龙在全明星赛上分享了MVP荣誉。马龙得到28分10个篮板，而斯托克顿贡献9分15次助攻，西部明星队135比132在加时赛获胜。斯托克顿是加时赛的功臣，他命中两记投篮并策动两次以上的得分，协助西部队16比13胜出。
1993-1994赛季，斯托克顿助攻超过9000次，与历史上仅次于魔术师约翰逊的9921次和奥斯卡·罗伯特森的9887次，除此之外他保持着赛季助攻王的荣誉——每场12.6次。他此外仍然场均交出15.1分2.43次抢断，投篮命中率52.8%的成绩单。他在抢断榜排名第四，投篮命中率高于所有其他后卫。他连续参加了第六次全明星赛，并在职业生涯中赛季末首次入选最佳阵容一队。斯托克顿的持续优异使爵士队又一次出现在西区决赛中，这次他们5场输给了休斯敦火箭队。
在经历了1995年季后赛速败火箭，1996年西区决赛不敌超音速之后，斯托克顿终于在1996-1997赛季和他的犹他爵士一起获得了突破，他们开始了连续两年的总决赛之旅，对手同样是芝加哥公牛。1996-97年，爵士的战绩是西部最佳的64胜18负，斯托克顿最终在助攻榜上落后于马克·杰克逊，将自己创造的连续获得助攻王纪录定格在九次。他再次进入西部全明星队的首发阵容。在全明星赛上得到12分5次助攻。在爵士的20场季后赛中，斯托克顿平均得到16.9分9.6次助攻和1.65次抢断。他在同火箭的西部决赛第二场独取26分12次助攻。又在关键的第六场得到25分。在总决赛，斯托克顿以17分12次助攻在第三战为球队带来第一场胜利，104比93。第四场，他又拿下17分，包括一次关键的远投和一记鬼斧神工的长传，爵士78比73扳成2比2平。第五场乔丹克服胃痛，公牛以90比88拿下天王山之战。然后他们在第六场90比86主场结束了总决赛。
在为膝盖手术休息了前18场比赛之后，
斯托克顿投入到1997-98赛季的征战当中。他每场助攻8.5次，排名联盟第五，犹他爵士队第二次回到总决赛。他们拥有全联盟最好的常规赛战绩62胜20负（和公牛并列）。并在总决赛第一场主场以88比85加时赛取胜。公牛再一次在六场比赛中击败了爵士，拿下了8年第6座总冠军，关键的第六场，仍然是乔丹最后关头的抢断和跳投决定了比赛。
在1988-89到1990-91这几个赛季，斯托克顿打出职业生涯最好的数据。他的平均得分超过17分，助攻在13.6到14.5之间。而在1993-94，1994-95这两年，他的投篮命中率在联盟后卫中排名第一。他在1993-94，1994-95这两个赛季被选入NBA最佳阵容一队，并在95年成为NBA历史上的助攻王。1994-95赛季结束前。斯托克顿助攻突破10000次。接下来的1995-96赛季，他超过莫里斯·奇克斯成为历史抢断王，而且超越鲍勃库西成为第一个连续九次获得助攻王的球员。
末期
在因劳资纠纷而缩
水的1998-99赛季，爵士37胜13负，再次并列于联盟最佳战绩，与球队分享荣誉的是赛区
生涯末期
的老冤家圣安东尼奥马
刺，也是最终的冠军。爵士在西区半决赛就输给了波特兰开拓者，随后的一年，开拓者又是在同样的西区半决赛中，5场淘汰爵士队。
2000-2001赛季，球队的成绩开始下滑，但斯托克顿的助攻数反弹到联盟第二（每场8.7次）仅次于太阳队的贾森·基德（每场9.8次）。接下来的两个赛季球队只是勉强让胜率超过50%，逼近40岁的斯托克顿仍然像以往一样有效率。
在职业生涯的第十八个赛季，也就是2001-02赛季，斯托克顿创造了代表同一支球队参赛场次的联盟历史纪录，他也成为史上仅有的10个40岁以上的NBA球员中的一个，而助攻总数更是达到15000次。
2003年4月30日是他职业生涯最后一场比赛，他上场28分钟得到8分1板7助。
斯托克顿最终在2002-03赛季结束了他的职业生涯。他参赛1504场，这在NBA历史上排第三位，次于罗伯特·帕里什的1611场和卡里姆·阿卜杜尔-贾巴尔的1560场。而他的得分19711分，也位列联盟历史的第33位（2013年1月1日被勒布朗·詹姆斯超越）。
2003年5月2日，约翰·斯托克顿正式宣布退役，同年6月7日举行退役仪式。在斯托克顿整个职业生涯中，他共参加了1504场比赛，缺席22场，共得19711分，15806次助攻和3265次抢断。199-91赛季，斯托克顿以1164次助攻创造了NBA历史上单赛季最高的助攻数；1989-90赛季，斯托克顿还以平均每场14.5次助攻创造了NBA历史上一赛季平均每场助攻数的最高纪录。
斯托克顿的一生拥有大量光辉的纪录，包括联盟史上后人再难企及的15806次助攻、联盟历史上最高的3265次抢断、19个赛季中17次打满82场、作为一个小个子后卫队员51.5%的职业生涯命中率。其他助攻纪录包括单赛季1164次，单赛季平均14.5次，连续9年助攻王、季后赛单场24次助攻、平均每场10.5次助攻列历史第2位、常规赛单场28次助攻则是历史第3。
斯托克顿加盟之后，犹他爵士没有错过一次季后赛，他们在七年间五次杀入西区决赛。
国家队经历
1992年，斯托克顿加入了美国国家队，这支队伍后来被人们称为“梦之队”。因为
腿伤的原因，斯托克顿没有怎么投入比赛。美国队最终站上了最高领奖台。
四年之后，斯托克顿又参加了96年的亚特兰大奥运会，再次得到奥运金牌。
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